Două variante:
1. Rulează script-ul de modificare într-o fereastră separată, la care nu se aplică timeout-ul (în mod implicit, timeout-ul de la Options / Query Execution / Execution time-out este 0, adică unlimited). Pentru asta, apeşi butonul "Generate Change Script" (din stânga sus), copiezi script-ul într-un "New Query" şi îl execuţi acolo.
2. Modifici timeout-ul de la Options / Designers / Table and Database Designers la o valoare mai mare (maxim 65535 secunde, adica vreo 18 ore).

Răzvan